MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus TW20

Total Repeats: 58788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017331	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141639
2	NC_017331	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141639
3	NC_017331	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141639
4	NC_017331	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141639
5	NC_017331	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141639
6	NC_017331	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141639
7	NC_017331	CAA	2	6	806	811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141639
8	NC_017331	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141639
9	NC_017331	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	387141639
10	NC_017331	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141639
11	NC_017331	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	387141639
12	NC_017331	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141639
13	NC_017331	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141639
14	NC_017331	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141639
15	NC_017331	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141639
16	NC_017331	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141639
17	NC_017331	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141639
18	NC_017331	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141639
19	NC_017331	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141639
20	NC_017331	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141639
21	NC_017331	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141639
22	NC_017331	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141639
23	NC_017331	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141639
24	NC_017331	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	387141639
25	NC_017331	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	387141639
26	NC_017331	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141639
27	NC_017331	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141639
28	NC_017331	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	387141639
29	NC_017331	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	387141639
30	NC_017331	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	387141639
31	NC_017331	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141639
32	NC_017331	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141639
33	NC_017331	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	387141639
34	NC_017331	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	387141639
35	NC_017331	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141639
36	NC_017331	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141639
37	NC_017331	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	387141640
38	NC_017331	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141640
39	NC_017331	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141640
40	NC_017331	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141640
41	NC_017331	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141640
42	NC_017331	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141640
43	NC_017331	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	387141640
44	NC_017331	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	387141640
45	NC_017331	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	387141640
46	NC_017331	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141640
47	NC_017331	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	387141640
48	NC_017331	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	387141640
49	NC_017331	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141640
50	NC_017331	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141640
51	NC_017331	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	387141640
52	NC_017331	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141640
53	NC_017331	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141640
54	NC_017331	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	387141640
55	NC_017331	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141640
56	NC_017331	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141640
57	NC_017331	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	387141640
58	NC_017331	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141640
59	NC_017331	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141640
60	NC_017331	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141640
61	NC_017331	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141640
62	NC_017331	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141640
63	NC_017331	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141640
64	NC_017331	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141640
65	NC_017331	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141640
66	NC_017331	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	387141640
67	NC_017331	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	387141640
68	NC_017331	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	387141640
69	NC_017331	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141640
70	NC_017331	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141640
71	NC_017331	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141640
72	NC_017331	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141640
73	NC_017331	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	387141640
74	NC_017331	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141641
75	NC_017331	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141641
76	NC_017331	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141641
77	NC_017331	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141641
78	NC_017331	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	387141641
79	NC_017331	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	387141641
80	NC_017331	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	387141641
81	NC_017331	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141642
82	NC_017331	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	387141642
83	NC_017331	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141642
84	NC_017331	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	387141642
85	NC_017331	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141642
86	NC_017331	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387141642
87	NC_017331	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141642
88	NC_017331	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141642
89	NC_017331	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141642
90	NC_017331	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	387141642
91	NC_017331	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141642
92	NC_017331	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141642
93	NC_017331	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141642
94	NC_017331	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141642
95	NC_017331	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141642
96	NC_017331	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141642
97	NC_017331	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141642
98	NC_017331	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141642
99	NC_017331	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141643
100	NC_017331	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	387141643
101	NC_017331	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	387141643
102	NC_017331	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141643
103	NC_017331	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	387141643
104	NC_017331	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141643
105	NC_017331	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	387141643
106	NC_017331	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141643
107	NC_017331	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141643
108	NC_017331	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141643
109	NC_017331	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141643
110	NC_017331	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	387141643
111	NC_017331	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141643
112	NC_017331	A	6	6	5493	5498	100 %	0 %	0 %	0 %	387141643
113	NC_017331	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141643
114	NC_017331	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	387141643
115	NC_017331	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141643
116	NC_017331	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141643
117	NC_017331	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141643
118	NC_017331	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141643
119	NC_017331	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141643
120	NC_017331	TACG	2	8	5888	5895	25 %	25 %	25 %	25 %	387141643
121	NC_017331	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141643
122	NC_017331	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141643
123	NC_017331	TATC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	387141643
124	NC_017331	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141643
125	NC_017331	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141643
126	NC_017331	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387141643
127	NC_017331	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141643
128	NC_017331	A	6	6	6222	6227	100 %	0 %	0 %	0 %	387141643
129	NC_017331	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141643
130	NC_017331	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141643
131	NC_017331	G	6	6	6351	6356	0 %	0 %	100 %	0 %	387141643
132	NC_017331	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	387141643
133	NC_017331	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	387141643
134	NC_017331	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141643
135	NC_017331	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387141643
136	NC_017331	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141643
137	NC_017331	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	387141643
138	NC_017331	AATG	2	8	6788	6795	50 %	25 %	25 %	0 %	387141643
139	NC_017331	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141643
140	NC_017331	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141643
141	NC_017331	TCAA	2	8	7019	7026	50 %	25 %	0 %	25 %	387141644
142	NC_017331	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141644
143	NC_017331	A	6	6	7197	7202	100 %	0 %	0 %	0 %	387141644
144	NC_017331	TATC	2	8	7255	7262	25 %	50 %	0 %	25 %	387141644
145	NC_017331	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387141644
146	NC_017331	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141644
147	NC_017331	ATGG	2	8	7341	7348	25 %	25 %	50 %	0 %	387141644
148	NC_017331	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141644
149	NC_017331	TAA	2	6	7421	7426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387141644
150	NC_017331	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141644
151	NC_017331	AG	3	6	7467	7472	50 %	0 %	50 %	0 %	387141644
152	NC_017331	GGTA	2	8	7532	7539	25 %	25 %	50 %	0 %	387141644
153	NC_017331	CCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387141644
154	NC_017331	TAAG	2	8	7597	7604	50 %	25 %	25 %	0 %	387141644
155	NC_017331	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141644
156	NC_017331	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	387141644
157	NC_017331	GAA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141644
158	NC_017331	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141644
159	NC_017331	A	6	6	7828	7833	100 %	0 %	0 %	0 %	387141644
160	NC_017331	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141644
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162	NC_017331	CAT	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141644
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164	NC_017331	ATT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141644
165	NC_017331	GTT	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387141644
166	NC_017331	AGA	2	6	8094	8099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141644
167	NC_017331	ATT	2	6	8184	8189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141644
168	NC_017331	CAA	2	6	8238	8243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387141644
169	NC_017331	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387141644
170	NC_017331	AG	4	8	8312	8319	50 %	0 %	50 %	0 %	387141644
171	NC_017331	TTA	2	6	8346	8351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141644
172	NC_017331	TGA	2	6	8384	8389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141644
173	NC_017331	TTA	2	6	8397	8402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141644
174	NC_017331	AGTT	2	8	8404	8411	25 %	50 %	25 %	0 %	387141644
175	NC_017331	TGA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141644
176	NC_017331	TCG	2	6	8453	8458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141644
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239	NC_017331	CT	3	6	11304	11309	0 %	50 %	0 %	50 %	387141646
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244	NC_017331	TA	3	6	11512	11517	50 %	50 %	0 %	0 %	387141646
245	NC_017331	AGA	2	6	11523	11528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141646
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248	NC_017331	ACG	2	6	11686	11691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141646
249	NC_017331	AATG	2	8	11802	11809	50 %	25 %	25 %	0 %	387141646
250	NC_017331	GGT	2	6	11866	11871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387141646
251	NC_017331	ATC	2	6	11906	11911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387141646
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253	NC_017331	GAT	2	6	12036	12041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141646
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255	NC_017331	AAG	2	6	12131	12136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387141646
256	NC_017331	GCT	2	6	12160	12165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387141646
257	NC_017331	ATT	2	6	12181	12186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387141646
258	NC_017331	GT	3	6	12200	12205	0 %	50 %	50 %	0 %	387141646
259	NC_017331	AGC	2	6	12234	12239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387141646
260	NC_017331	ATG	2	6	12287	12292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141646
261	NC_017331	CCAT	2	8	12310	12317	25 %	25 %	0 %	50 %	387141646
262	NC_017331	CAAT	2	8	12373	12380	50 %	25 %	0 %	25 %	387141646
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264	NC_017331	GAT	2	6	12849	12854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387141647
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